Pada tanggal 15 Juli 2006, SMPIT Auliya secara resmi diserahterimakan kepada yayasan yang mengelolanya dan sekaligus menandai dimulainya awal tahun ajaran baru 2006/2007. Sekolah tersebut mulai dibangun pada awal bulan Maret 2006 dan diselesaikan pengerjaannya selama 4,5 bulan.